白菜种子基因表达
白菜种子基因表达的研究涉及多个方面,包括特定基因的表达水平、基因表达差异、以及基因表达与生长发育的关系。以下是一些关键的研究内容和发现:
FLC基因表达水平研究
研究不同大白菜新种质中FLC基因的表达水平,探究其表达水平的差异,并分析FLC基因及其表达对不同品种大白菜生长发育的影响。
转录组测序分析
通过转录组测序,发现3379个差异显著的表达基因,其中包括4个FLC基因家族成员。春化导致种子中FLC的表达受到抑制,而VIN3的表达量显著增加。
基因甲基化分析
全基因组DNA甲基化测序结果显示,春化导致734个基因甲基化水平提高,580个基因甲基化水平下降。结合转录组和基因组甲基化差异基因分析,发现56个基因的表达水平与甲基化程度表现出负相关。
PRR5基因克隆与表达
克隆普通白菜中的PRR5同源基因Bra009768,分析其序列、蛋白结构和在不同器官及不同发育时期的表达情况,并构建超表达载体进行功能验证,以明确其在普通白菜中的功能。
基因差异表达分析
利用cDNA-AFLP技术研究大白菜白引2号杂交种及其亲本在不同发育期的基因差异表达,发现29条差异片段,其中5个差异片段出现在幼苗期,14个差异片段出现在莲座期,10个差异片段出现在结球期。
白菜基因组组装
中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队利用三代测序技术,获得接近完整的白菜基因组,揭示了白菜着丝粒的快速进化特征。